La parte acusatoria solicitó 18 años de prisión para él. Whelan mismo en la última palabra dijo que no estaba involucrado en espionaje. Tiene la intención de apelar el veredicto.
El proceso fue monitoreado de cerca por los Estados Unidos, el embajador estadounidense acudió repetidamente a las reuniones, pero nunca se le permitió ir directamente a la sala del tribunal. Dado que fue clasificado como «alto secreto» el caso, la diligencia fue de régimen cerrado.
La investigación no reveló oficialmente la trama del caso: del comunicado de prensa del Servicio Federal de Seguridad-FSB se dedujo que Whelan fue detenido en Moscú a fines del 2018 durante una campaña de espionaje. La defensa afirma que el estadounidense fue víctima de una supuesta provocación: le dieron una unidad flash en la que supuestamente esperaba ver una foto de un viaje turístico a Sergiev Posad.